Thomas F. Duffy a débuté au cinéma en jouant l'ennemi de Charles Bronson dans Un Justicier dans la Ville 2. On le retrouve également aux côtés de Jeff Goldblum dans Independence Day. Pour préparer son rôle de paléontologue dans Le Monde Perdu, Duffy contacta le paléontologue renommé Robert Bakker. Celui-ci lui proposa de se joindre à lui sur un chantier de fouilles dans le Wyoming. Au cours de ces fouilles, Duffy mit au jour 40 fossiles de dinosaures.